National LifeScience Supercomputer

Podcast: Supercomputer fremmer udviklingen af genomisk medicin

Rigshospitalets Center for Genomisk Medicin undersøger patienternes gener for at finde ud af, hvad de fejler og hvordan de skal behandles. Det kræver en masse computerkraft at analysere de enorme mængder data. Derfor har Rigshospitalet valgt at benytte den Nationale Supercomputer Computerome, både til forskning og til den daglige drift med lagring og analyser af de genetiske data.

Dansk

Forskere fra tre universiteter udfører banebrydende genomforskning med Computerome

Dansk
Bent Petersen
"Computerome var en afgørende faktor for, at det lykkedes os at danne et referencegenom, der er blandt de mest detaljerede i verden," siger lektor Bent Petersen, DTU Bioinformatik.

En artikel i det ansete videnskabelige tidsskrift Nature er seneste resultat af forskningsprojektet Genome Denmark, der begyndte i 2012. Formålet var at opbygge et referencegenom over danskernes arvemasse.

DeIC og supercomputercentre inviterer forskere til temadag om supercomputere

Hvordan kan jeg anvende supercomputere i min forskning?

Det spørgsmål vil DeIC gerne hjælpe forskere med at besvare. Derfor indbyder DeIC eScience kompetencecenter sammen med de nationale supercomputercentre forskere til temadag om supercomputere den 7. november på DTU.

På dagen er DeICs tre nationale supercomputere repræsenteret: Abacus 2.0 ved Syddansk Universitet i Odense, Computerome ved DTU Risø og Kulturarvsclusteret ved Statsbiblioteket i Aarhus.

Dansk

Eske Willerslev taler på DeIC konferencen

"Hvad kan vi lære af oldtidsgenetik?" Det er titlen på den afsluttende keynote på DeIC konference 2016, der finder sted i Kolding 4.-5. oktober.

Indlægget holdes af en Danmarks førende eksperter på området, professor Eske Willerslev fra Center for GeoGenetik under Statens Naturhistoriske Museum, Københavns Universitet.

Dansk

Video: Neuralt netværk afslører bakteriers indsprøjtningsmekanisme

Nogle bakterier kan direkte sprøjte proteiner ind i andre celler for at inficere dem. Det gælder fx klamydia, salmonella og listeria. Videnskaben har ganske godt styr på, hvordan indsprøjtningsfunktionen fungerer – men man ved mindre om, hvilke proteiner der bliver injiceret, og hvilke signaler de giver cellen.

Det forsøger et DeIC pilotprojekt nu at afdække.

Dansk

Computerome er årets grønne datacenter

Ved konferencen Version2 Datacenter modtog DeIC Nationale LifeScience Supercomputer, DTU (Computerome), prisen som Årets grønne datacenter. Prisen er indstiftet af Version2, kommunikationsfirmaet Frontal og energirådgivningsvirksomheden E|Optimo.

Forud for prisuddelingen gik en online konkurrence, hvor man kunne nominere og stemme på datacentre. Her fik en løsning fra NNIT flest stemmer.

Dansk

Video: DeIC pilotprojekt kan løse problem med organtransplantation

Et forskningsprojekt vil kortlægge HLA-generne (humant leukocyt antigen) ved hjælp af DeICs nationale life-science supercomputer.

HLA-systemet er med til at bestemme, om en organtransplantation lykkes. Hvis der er for store forskelle mellem HLA-molekylerne hos patienten og i transplantatet, kan det blive udstødt. Derfor er det vigtigt at kunne typebestemme HLA-systemet. Hvert individ har sin egen bestemte kombination af HLA-molekyler.

Dansk

Sider

Abonnér på RSS - National LifeScience Supercomputer